堆肥的分解过程是有机肥发酵剂分解有机物的过程，堆肥的快速和缓慢的腐熟与微生物的活性密切相关。因此，要加速堆肥和催熟，先要控制微生物的活性。堆肥过程中影响微生物生命活动的主要因素如下：

　　（1） 湿气。堆肥含水率是空箱堆肥成败的条件。一般含水量为原料的60%～75%，有利于植物茎的软化和细菌的生长、运动，使堆肥料较快的均匀成熟。含水率60%-75%的简易测试方法是：当堆肥材料挤压紧密时，挤出少量水分，即含水率适宜。

　　（2） 温度。大多数微生物活动的比较适合的温度为50-60℃℃, 温度在55-65度之间℃ 堆肥时保存约1周。它能推动高温纤维素分解菌对有机物的分解，进而维持40-50℃的中温期℃ 推动氨化和养分释放。堆肥中的温度调节可以通过添加和减少马粪、水和覆盖含有高培养纤维素分解菌的厚土来实现。

　　（3） 空气。保持适量的空气有利于有机肥发酵剂中好氧微生物的繁殖和活动，推动有机物的分解。通风不良会抑制好氧微生物的活性，堆肥温度不易升高，堆肥积累缓慢；曝气过强，好氧微生物繁殖过快，有机质大量分解，腐殖质系数低，氮素损失大。适当的通风可通过控制含水率、包装严密性和设置通风沟或风管来调节。

　　（4） 大多数微生物适合在pH6.4-8.1的中性至微碱性环境中活动。堆肥是由于有机物分解过程中产生大量的有机酸，导致堆肥中酸的增加。为了降低酸度，保持微生物适宜的生长环境，在堆肥过程中加入相当于秸秆的2-3%石灰等原料，降低酸度。同时，石灰能破坏秸秆表面的蜡，使秸秆易于吸水，软化，加速发酵。

　　（5） 微生物分解有机物的适宜碳氮比（c/n）为25:1，而日常生活中使用的堆肥材料一般较大，由于缺乏氮营养，生活和其中的微生物不活跃，分解缓慢；当碳氮比被称为时，有机物就会大量流失。因此，应在有机肥发酵剂堆肥中添加适量的人畜粪便、无机氮肥或碳氮比较小的绿肥，以调整适宜的碳氮比。